《自然-方法》杂志上的科学文章: 通过深度学习从串联质谱预测聚糖结构
“使用这种方法,我们很快就能达到与其他生物序列(如DNA、RNA或蛋白质)测序相同的准确度,”丹尼尔说。
丹尼尔是化学与分子生物学系以及瓦伦堡分子与转化医学中心生物信息学的副教授。
聚糖结构可以通过质谱进行测量。聚糖还可以显示细胞中的癌症等其他信息。分析这些数据每个样本需要手动工作数小时甚至数天。
在人工智能和深度学习模型的帮助下,现在可以在不需要这些方法的专业知识的情况下以闪电般的速度进行分析。这对于丹尼尔来说一直是一个重要的目标。
“使系统生物学和糖组学更易于被生命科学家普遍接触,将为临床和转化研究带来好处。通过这些技术更容易获得,那些没有糖组学专业知识的研究人员现在可以将聚糖纳入其研究中。这很重要,因为聚糖在人类体内发生的几乎所有事情中都发挥着重要作用 ”
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